В миру Вознесенский Семен Саввич, родился в 1793 году в городе Козельске Калужской губернии в семье священника.

В 1815 году, по окончании курса Калужской духовной семинарии, поступил в Санкт-Петербургскую духовную академию.

В 1819 году окончил академию со степенью кандидата богословия и был определен учителем словесности и еврейского языка в Полтавскую духовную семинарию.

14 сентября 1821 года пострижен в монашество, 1 октября рукоположен во иеродиакона, 9 октября – во иеромонаха.

С 1 сентября 1823 года – инспектор Полтавской духовной семинарии.

С 21 января 1826 года – ректор Тульской духовной семинарии.

С 11 апреля 1826 года – архимандрит Белевского Спасо-Преображенского монастыря.

С 27 февраля 1829 года – ректор Астраханской духовной семинарии и настоятель Астраханского Спасо-Преображенского монастыря.

С 22 сентября 1831 года – ректор Тамбовской духовной семинарии.

29 апреля 1832 года переведен в Черниговскую духовную семинарию и назначен настоятелем Елецкого Черниговского Успенского монастыря.

12 августа 1834 года хиротонисан во епископа новоучрежденной Томской епархии митрополитом Московским Филаретом (Дроздовым).

10 июня 1841 года, по собственному прошению, уволен на покой и назначен членом Московской Синодальной Конторы.

18 декабря 1843 года назначен управляющим Новоиерусалимским монастырем.

2 марта 1850 года переведен в Московский Новоспасский монастырь, а 31 июня 1852 года – в Донской Богородичный монастырь.

Скончался 1 января 1854 года в Москве.

Строгий монах в личной жизни, он не способен был угождать людям и потворствовать слабостям.

Митрополит Московский Филарет (Дроздов), рукополагавший его во епископа, уважал в нем человека благочестивой жизни и всегда оказывал ему поддержку, особенно в трудных обстоятельствах его жизни, например, когда в епархии не полюбили строгого к себе и другим архипастыря и на него стали поступать жалобы в Св. Синод. Под влиянием митрополита Филарета, обер-прокурор Св. Синода граф Протасов поручил епископу Камчатскому Иннокентию (Вениаминову) при поездке его через Сибирь в свою епархию собрать и доставить сведения о причине жалоб на Агапита.

Преосвященный Иннокентий, между прочим, сообщал: “Агапит обращался со мною по-братски. Он есть ревнитель совершенной правды и законов, в особенности христианского. Он, несмотря ни на какие обстоятельства и отношения, от всех требует точного исполнения своих обязанностей. Он требовал от всех вступающих в брак знания заповедей и пр. Это почли и почитают притеснением”.

Вообще же он был человек симпатичный, добрый, правдивый, по жизни – строгий монах.

С другой стороны, он не отличался энергичностью и деловитостью. Будучи членом Московской Синодальной Конторы, преосвященный Агапит состоял во главе официально назначенной следственной комиссии по доносу на Павского. По отзыву священника Миловского Н., Агапит был следователь плохой, не умевший взяться за дело как нужно. Допросы учинял длинные-предлинные.

Труды:

• Краткое поучение в Неделю сыропустную, говоренное Агапитом, епископом Томским в домовой архиерейской церкви 1836 года // “Христианское чтение” 1838. ч. 1, с. 232 – 236.
• Слово, произнесенное Московской синодальной конторы членом преосвященным епископом Агапитом по случаю освящения на 8-й день сентября 1846 года по Высочайшей воле устроенного придела в память рождения Его Императорского высочества великого князя Александра Николаевича в большой церкви Воскресенского, Новый Иерусалим именуемого, монастыря // Там же. 1846. Ч. 4. С. 287-301.